门诊特殊病种共有17个病种。其中恶性肿瘤（化疗、放疗）、慢性肾功能衰竭（血透）、老年性白内障（晶体植入治疗）限于在二级或三级医院治疗；恶性肿瘤（非化疗和非放疗）、慢性肾功能衰竭（腹透）、器官移植术后（抗排斥治疗）、结核病、肝硬化失代偿期、性早熟、高血压III期、糖尿病、脑中风、精神分裂症、血友病、再生障碍性贫血、帕金森氏综合症、系统性红斑狼疮等限于一级医疗机构治疗；其他病种小儿脑瘫、肝胆和泌尿系结石可依据病情在任一定点医疗机构治疗。支付比例：一级医院90%，二级医院75%，三级医院70%（从2012年8月1日起执行）。